الأهداف الإستراتيجية

1/ تأمين صحة القطيع القومي دفعاً للأمن الغذائي وصادرات الثروة الحيوانية والسمكية
2/ تأهيل وتطوير المحاجر والمسالخ لمواكبة المواصفات العالمية.
3/ تأهيل وتطوير الخدمات البيطرية بالولايات.
4/ تأصيل الأنواع السودانية ورفع كفاءتها الإنتاجية.
5/ الأستمرار في تحسين سلالات إنتاج اللحوم بإدخال نظم الإنتاج المكثف لمواكبة متطلبات الأسواق العالمية وزيادة قدرتها التنافسية.
6/ الأستمرار في اعداد المواصفات القياسية للمنتجات الحيوانية السودانية ومطابقتها بالمواصفات العالمية.
7/ الإهتمام بادخال التقنيات الحديثة بهدف تجويد الاداء.
8/ تشجيع الإستثمار في مجالات الثروة الحيوانية والسمكية لتحقيق الأمن الغذائي ودعم الصادر.
9/ إنشاء آلية فنية للتسويق بالوزارة لتوفير المعلومات التسويقية عن الاسواق الداخلية و الخارجية للمنتجات الحيوانية و السمكية.
10/تطوير وتأهيل الإرشاد البيطري و دعم برامج تنمية الرعاة.
11/المساهمة في برامج مكافحة الفقر وزيادة دخول الأسر.
12/ توفير الأدوية واللقاحات والمستحضرات البيطرية ومراقبة استخداماتها.
13/ تنظيم العمل الدوائي من خلال الإشراف على إستيراد الأدوية وتسجيلها.
14/الإرتقاء بمستوي الرقابة الدوائية وذلك بإدخال التقنية في إعداد مصادر خاصة بدساتير الأدوية العالمية وإعداد سجلات خاصة بأسماء الأدوية المسجلة بالسودان.
15/ توفير مدخلات الأنتاج الداجني والسمكي محلياً بالتركيز علي الإستغلال الأمثل للموارد المحلية

16/ العمل علي إدخال الثروة الحيوانية بالولايات الجنوبية في دائرة الإقتصاد القومي.
17/ تنمية وتأهيل البنية التحتية للمناطق المتأثرة بالحرب.
18/ إقامة مزارع إنتاجية نموذجية.
19/ عمل التشريع الإتحادي والولائي لدعم عملية الإنتاج والتسويق وضبط الجودة وحماية المستهلك وحماية البيئة.
20/ متابعة برامج إستيعاب خريجي البيطرة والإنتاج الحيواني والموارد الطبيعية في المجالات المناسبة في القطاع العام والخاص.